直到2016年4月才缴纳住房公积金。公司现在可以申请住房公积金五年吗？

公司不能申请补缴之前未缴的住房公积金为五年期限。分析：根据《住房公积金管理条例》，单位应当为职工自入职之日起缴纳住房公积金。您2011年入职，但2016年才开始缴纳，公司存在违法行为。住房公积金的补缴应基于实际欠缴年限进行，而非公司单方面决定补缴五年。提醒：若公司拒绝按实际欠缴年限补缴，或因此导致您的权益受损，表明问题已较严重，应及时咨询专业律师或向住房公积金管理中心投诉。
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处理方式：从法律角度，处理此类问题的方式主要有两种：一是与公司协商，要求其按实际欠缴年限补缴住房公积金；二是向住房公积金管理中心投诉，由管理部门介入处理。选择建议：首先尝试与公司协商，若公司态度积极且能达成一致，则问题可较快解决。若协商无果，或公司态度消极，则应考虑向住房公积金管理中心投诉，以法律手段维护自身权益。
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具体操作：1.协商阶段：收集好入职证明、工资单等证据，与公司人力资源部或财务部门沟通，明确指出其欠缴住房公积金的事实，要求按实际欠缴年限补缴。2.投诉阶段：如协商无果，可向当地住房公积金管理中心提交书面投诉，附上相关证据材料。管理中心将进行调查，并依据调查结果要求公司补缴。3.法律诉讼：若管理中心的处理未能满足您的要求，或公司拒绝执行管理中心的决定，您可考虑提起行政诉讼，由法院裁决。在此过程中，建议聘请专业律师代理，以确保诉讼顺利进行并维护自身权益。请注意，在处理此类问题时，务必保留好所有相关证据，以便在必要时提供证明。